Question

¿los españoles consideraban ciudadanos a los incas?

Answer 1

De hecho no! 
Cuando los español llegan a América, chocan con una cultura muy distinta a la de ellos, lo cual digamos "los asustan", porque no olvidar cuando ellos le presentan la biblia a los incas, estos lo botan como si no valiera nada cosa que a los españoles les molesto muchísimo, ya que se metían con su religión. Entonces los español aprovecharon de su falta de tecnología para invadirlos, con el tiempo hubo muchos incas que se rebelaban lo cual hizo que los españoles hagan ciertas leyes en el cual les daba algunos derechos, pero todas maneras los incas eran maltratados.