Es el conjunto formado por organismos, medio ambiente y la relación de intercambio de materia y energía entre ambos.
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Un ecosistema está formado tanto los organismos vivos que se encuentran en un lugar determinado, como el medio ambiente que los rodea, interactuando ambos componentes mediante el intercambio de materia y energía.
Los organismos vivos forman la biocenosis de un ecosistema, mientras que el lugar y medio ambiente constituyen el biotopo. Las interacciones que ocurren dentro de un ecosistema son entre los mismos organismos, y entre estos y su biotopo.
Entre los seres vivos ocurren los intercambios de materia y energía a través de las cadenas tróficas, en tanto que la interacción con el medio ambiente ocurre mediante los ciclos del oxígeno, dióxido de carbono, nitrógeno y carbono.
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