Question

1. ¿Por qué razón “separado” se escribe todo junto y “todo junto” se escribe separado?
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Answer 1

porque separado es una palabra y todo junto son 2 palabras

Answer 2

Porque lo contrario de "separado" no es "todo junto" sino "junto". La combinación "todo separado" no es tan frecuente como la de "todo junto", quizás porque lo que está junto forma siempre un todo mientras que lo que está separado no.